2019年脑中心购置了东北地区首台专门用于科研的GE DiscoveryMR750 3T研究型磁共振成像仪。2022年对仪器进行了全面的升级，购置了32通道的头部专用线圈以及Signa Works功能拓展。升级后的设备能够进行极速同步多层扫描，显著提升时间分辨率，提供了更优异的脑功能成像稳定性和较高的信噪比，可以采集高分辨率结构像、功能磁共振图像、弥散张量图像等多种模态的磁共振数据。
依托磁共振成像平台，脑中心承担了国家重大专项项目1项以及多项国家自然科学基金项目。同时积极开展校内外服务工作，与本单位其他学院以及多所高校共享了实验平台。
